国际首个兰科藤本植物完成基因组测序
中新网福州2月7日电 (记者 龙敏)福建农林大学7日对外通报,已完成深圳香荚兰基因组测序的全部工作。这标志着香荚兰成为国际上第一个完成测序的兰科藤本植物,意味着人类将获取第一个重要香料植物的基因组图谱。
据了解,香荚兰(Vanillasp。)为兰科香荚兰属植物,又名香子兰、香草兰、香草、香兰,是典型的热带雨林中的一种大型兰科香料植物,并因其独特而无法人工合成的香味,被广泛应用于食品、化妆品、烟草等行业,被誉为“香料皇后”。现今,香荚兰已是仅次于藏红花的世界第二昂贵香料,在美国市场上每公斤香荚兰果荚高达90美元,而且前景广阔,行情看涨。
福建农林大学校长兰思仁教授介绍,兰科植物占全世界植物种类10%,是世界性的濒危物种,是植物界最大和进化程度最高的家族之一,是生物多样性和进化研究以及生物保护的“旗舰”和理想的模式类群,具有极高的科研、生态、观赏、文化和药用价值,是中国最珍贵的野生植物资源之一。
兰思仁说,由于目前全球尚未有对香荚兰进行基因组测序及分析的成功案例,而其所在的香荚兰亚科在基因组测序上也仍处于空白状态,福建农林大学联合国家兰科植物种质资源保护中心(深圳)于2014年7月启动了“香荚兰基因组项目”,计划率先对深圳香荚兰进行全基因组测序和生物信息分析,同时对相关种类的转录组进行测序和分析。
国家兰科植物种质资源保护中心(深圳)主任刘仲健介绍,经过双方科研人员的共同努力和深入研究,目前已经完成了深圳香荚兰基因组测序工作;已经获得260Gb测序数据,基因组大小约800Mb,测序深度为325X,组装结果接近精细图标准,其中ScaffoldN50=288Kb,ContigN50=22Kb,基因数量约29000个,杂合度约1.14%,属于高杂合复杂基因组。
国家林业局野生动植物保护与自然保护区管理司副司长刘亚文表示,项目的顺利完成为揭示兰科植物起源和系统演化研究奠定了重要基础,为香荚兰保育研究工作和产业化提供新的突破口,有利于大力推进香荚兰乃至所有兰科植物相关产业链的发展,对加强兰科植物保护、兰花品种创新和提升中国在生物学、生物多样性等领域的研究水平具有重大的意义,也标志着中国兰科植物基因组测序技术的进一步成熟。(完)